Creada en enero de 1994, estudia el polen atmosférico de nuestra ciudad diariamente. Los datos obtenidos se dan a conocer por medio de la prensa local, y así mismo se informa a las instituciones y particulares con interés en estos temas. La responsable de la Estación es la farmacéutica Alicia de Toro.
La Estación de Aerobiología del COFZ está asociada a la Red Aerobiológica Española (REA) cuyo centro coordinador está en la Universidad de Córdoba, centro a través del cual se comunican los resultados de todos los centros nacionales a la Red Europea (EAN EAN/EPI), con sede en la Universidad de Viena contribuyendo así a la creación y mantenimiento de un banco de datos internacional.